Эльке Байер училась в Кельнском университете, Университетском колледже Лондона и Колумбийском университете, Нью-Йорк. Защитила диплом по специальности История и Восточно-Европейские исследования. С 2002-2006 гг. — научный сотрудник проекта «Уменьшающиеся города», инициированного федеральным Фондом культуры. Работала ассистентом куратора выставок, организованных для этого проекта в Санкт Петербурге и Москве. Оосуществила выставочные проекты для проекта «Миграция» в Художественном объединении Кельна, Layered Histories и Das Ende der Staatsbank в Берлинском государственном банке. Преподает в Институте истории и теории архитектуры в швейцарском Техническом университете г. Цюриха; редактировала издание Schwellenatlas журнала Archplus.
Работает над диссертацией по теме «Производство социалистического урбанизма. Городской центр 60х годов в СССР и ГДР».