Томас Хайзе родился в 1955 году в восточном Берлине.
После школы обучался типографскому делу; за службой в армии (1974-75 годы) последовала работа ассистентом режиссера на Defa-Studio, с 1978 по 1983 годы учился в Высшей школе кино и телевидения в Бабельсберге (отчислен в 1983 году).
С 1983 по 1990 годы работал независимым режиссером и сценаристом, в период с 1990 по 1997 годы являлся членом Берлинского ансамбля. С 1997 года — режиссер театра и кино, сценарист; с 2001 года — член Академии искусств, Берлин.