Родился в Ньюарке, штат Нью-Джерси в 1932. Учился в Колумбийском университете и университете Корнелла в США, в Кембриджском университете в Великобритании. До основания своей мастерской в 1980 Айзенман был по преимуществу теоретиком и преподавателем архитектуры. В 1967 он основал Институт исследования архитектуры и градостроительства (Institute for Architecture and Urban Studies — IAUS), которым руководил до 1982 года. В 1985 он получил «Каменного льва» — первую премию — на III Архитектурной биеннале в Венеции за проект «Ромео и Джульетта». В 2004 получил «Золотого льва» за жизненный вклад в архитектуру на IX Архитектурной биеннале. Был одним из членов Нью-Йоркской пятерки (совместно с Дж. Хейдуком, Ч. Гуотми, Р. Майером и М. Грейвсом). Работы группы представляли так называемую нью-йоркскую архитектурную школу. В этот период Айзенман работал с геометрическими абстрактными композициями и творческим наследием Ле Корбюзье. В разное время П. Айзенман преподавал в Купер Юнион, Принстонском и Йельском университетах, он был учителем Даниэля Либескинда, из его архитектурного бюро вышли лидеры «блобмейстеров» — Грег Линн (Greg Lynn), Джеф Кипнис (Jeff Kipnis), Марк Уигли (Mark Wigley), Сэнфорд Квинтер (Sanford Kwinter). Начиная с 1990-х, Айзенман окончательно отказывается от деконструктивистского дискурса и переключает свои поиски в область нелинейной архитектуры. В качестве переломного момента можно обозначить кризис осени 1988 года, когда Айзенман окончательно осознал «смерть деконструктивизма»(чему способствовала организованная при поддержке Филипа Джонсона знаменитая выставка «Деконструктивистская архитектура» в нью-йоркском Музее современного искусства) и перед ним встал вопрос: «а что же дальше?». Новое вдохновение пришло со стороны современных открытий в науке, идеи самоорганизующихся органических структур, теории складки Ж. Делеза, теории фракталов.